学院现设公共教学部、眼视光学系、基础医学部、临床教学部四个教学单位，承担了全院各个专业、各个年级的公共基础课、基础医学课和各专业课的理论教学和实践教学任务。
公共教学部下设信息综合教研室、外语教研室、社会科学教研室、体育教研室和管理学教研室，承担公共基础课的教学工作，还可为学生开展各类外语培训、信息技术培训、出国考试培训和资格考试培训。
基础医学部下设形态学综合教研室、机能学综合教研室、生物学综合教研室和化学综合教研室，承担医学基础课的理论教学和实验教学，同时开展各级各类科研活动。
临床教学部下设临床医学教研室、护理学教研室、医学影像学教研室和临床实验中心四个二级教学单位，负责全院各层次学生临床理论课的教学工作，同时承担了全院各层次学生的生产实习岗前培训与考核等工作。