基础医学部现下设四个教研室，分别为形态学综合教研室（解剖学、组织胚胎学、病理学）、机能学综合教研室（生理学、病理生理学、药理学）、生物学综合教研室（生物学、病原生物学、免疫学、细胞生物学、遗传生物学）、化学综合教研室（基础化学、有机化学、生物化学、分子生物学）。
基础医学部人员平均年龄32岁，学缘构成合理，教师及实验员来自于中国医科大学、华西医科大学、哈尔滨医科大学、沈阳农业大学、东北大学、沈阳药科大学、大连医科大学、大连理工大学、辽宁中医药大学、辽宁医学院、沈阳医学院等院校。
目前教师队伍中有四人为留学归国者，二人即将出国留学。教师队伍以沈阳绿谷生物技术产业有限公司为依托，一边从事科学研究及研发，一边从事教学及教育教学改革。教师队伍已经成为教学水平高，科研能力强的一支综合素质高的师资队伍。
基础医学部全体教师正在以人本理念，以培养基础知识扎实、动手能力强、综合素质好的综合性人才为宗旨，不断地开展教育及教学改革，不断提高教学水平，为打造品牌专业不断探索，基础医学部已经成为沈阳医学院何氏视觉科学学院教学的中坚力量。